Patojen se yon tem kolektif pou mikwo-oganis ak parazit ki ka lakoz maladi. Microorganisms kont pou majorite nan vas, ki gen ladan viris, klamidya, riket, mycoplasma, bakteri, Spirochetes ak fon; parazit prensipalman gen ladan protozoa ak ve. Patojen yo se oganis parazit parazit, ak gen tout animal yo natirel yo se bet, plant ak imen. Gen plis pase 400 kalite mikwo-oganis ki ka enfekte imen, epi yo lajman prezan nan bouch imen, nen, fanm, dijestif tract, tract urogenital ak po.
Tout moun ka enfekte pa plis pase 150 kalite ajan patojen nan lavi yo. Anba kondisyon an nan fonksyon imen nomal, yo pa pral lakoz maladi, ak kek yo menm benefisye nan ko imen an. Pou egzanp, flora a entesten (E. coli, elatriye) ka sentez vitamin miltip. Egzistans lan nan sa yo flora kapab tou anpeche repwodiksyon an nan kek plis bakteri patojenik, se konsa sa yo mikwo-oganis yo rele microbiota nomal (nomal flora). Men, le se iminite ko a redwi, balans lan ant imen ak mikwo-oganis se Le detwi, flora a nomal kapab lakoz tou maladi, se konsa yo yo rele tou ajan patojen kondisyonel (pathogens kondisyonel). Si se ko a atake pa yon ajan pa ajan patojen oswa ou pa, sou yon sel men an, se ki gen rapo ak iminite pwop li yo, nan lot men an, li tou depann de patojen la nan pathogens la ak nimewo a nan envazyon. Anjeneral, pi gwo nimewo a, pi gwo posibilite pou maladi. An patikilye, ajan patojen ki pi feb patojen mande pou yon kantite lajan pi gwo lakoz maladi. Yon kek mikwo-oganis yo byen patojenik epi yo ka lakoz maladi ak enfeksyon limye, tankou kalamite, tipox, ak raj.